目前，各試點的數據核查工作主要還是由地方發改委主導，以地方發改委統一組織、分配、支付的方式進行。
3月5日，上海市發改委就納入企業2013年排放報告核查進行國內公開競爭性談判采購，將191家納入企業劃分為
鋼鐵、
電力、
化工等9個包件供10家備案機構競爭。
而據了解，
北京市納入企業的核查工作已經由北京發改委出資，統一分配到各家備案機構。根據北京市發改委公告，目前已有19家
核查機構經過備案。
在此前的初始盤查中，天津、上海兩個試點也由地方發改委發布了招標公告；北京市發改委通過通知的方式公布了核查安排。
在采訪中，有試點納入企業對21世紀經濟報道記者表示，擔心發改委指定核查機構的公平性，希望有自主選擇的權利。但同時，自主選擇也意味著很可能將有企業自身承擔核查費用。
廣東省就將這一點明確列出。根據《廣東省
碳排放管理試行辦法》，控排企業和單位應當委托核查機構核查碳排放信息報告，配合核查機構活動，并承擔核查費用。
根據此前試點核查經驗，每家企業所需核查費用在2萬-8萬元之間。上海市此次核查招標，預算限額共400萬元，均價2.09萬元一家。而此前北京市組織的初始核查，均價為10萬元一家。
但對于企業擔心的公平性
問題，各試點均在制度層面做出了較為嚴格的規定，并對
第三方核查機構的不合格規定了處罰措施。
一家上海納入企業表示，當地發改委曾向他們承諾，不會出現舞弊、作弊的情況。“我們也是比較相信的，我們企業內部自己也在核查。相差數額比較大的話，也有上訴的流程。”
在北京最新發布的報告報送通知中，也出現了“配額調整”一項，符合配額調整條件的納入企業，可以在4月5日前，向北京發改委提交2013年配額調整申請，由發改委于4月30日完成相關調整。（完）
